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Full text: Molekularbiologische Ansätze im traditionellen Monitoring - der behördliche Blick

Expertennetzwerk 
Wissen Können Handeln 
Methoden 
4. Bioinformatische Analyse 
Prozessieren mit dada2 Pipeline in R ... und eigene Skripte 
Amplicon Sequence Variants „ASVs“ = eindeutige Sequenz oder Haplotyp 
Abgleich der Sequenzen mit GenBank oder BOLD (öffentliche genetische Datenbanken) 
A ASWY_Table - Editor 
Datei Bearbeiten Format Ansicht Hilfe 
fL 1890 180 8.66e-163 313 KU9B6B13 crustaceans Amphibalanus improvisus /91B8 82/40 86145 19182 | 
2 79.167 98 4. /e-51 312 MMN469243 flies Phoridae_5p 4956 42/8 4531 1621 1122 2323 440 238 203 
3 99.681 1600 4.020e-161 313 M195225 bivalves Mytilus_trossulus @ 0 0 66088 /23310 85588 142 0 € 
4 160 100 8.66e-163 313 MT736558 crustaceans Balanus_crenatus 19 0 18 547/ 1854 250 73 27 13 7/5) 
5 99.681 160 4.83e-161 313 KM192129 bivalves Mytilus trossulus 0570090009000 009004]: 
6 100 1090 8.66e-163 3173 M139/87/ segmented_ worms Hediste diversicolor # 0 15 0 17 23 19 @ 11 « 
7 80.064 97 6.052-55 311 KXB96905 brown_algse Durvillaea_potatorum 180 453 57 0 / 0 3298 2993 
a O3 511 AA CC. CA 217 VFMAOCOARO basti Andre Frans in £A1E MMC A211 A410 A760 DATE D£7 217 
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