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Methoden
4. Bioinformatische Analyse
Prozessieren mit dada2 Pipeline in R ... und eigene Skripte
Amplicon Sequence Variants „ASVs“ = eindeutige Sequenz oder Haplotyp
Abgleich der Sequenzen mit GenBank oder BOLD (öffentliche genetische Datenbanken)
A ASWY_Table - Editor
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fL 1890 180 8.66e-163 313 KU9B6B13 crustaceans Amphibalanus improvisus /91B8 82/40 86145 19182 |
2 79.167 98 4. /e-51 312 MMN469243 flies Phoridae_5p 4956 42/8 4531 1621 1122 2323 440 238 203
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4 160 100 8.66e-163 313 MT736558 crustaceans Balanus_crenatus 19 0 18 547/ 1854 250 73 27 13 7/5)
5 99.681 160 4.83e-161 313 KM192129 bivalves Mytilus trossulus 0570090009000 009004]:
6 100 1090 8.66e-163 3173 M139/87/ segmented_ worms Hediste diversicolor # 0 15 0 17 23 19 @ 11 «
7 80.064 97 6.052-55 311 KXB96905 brown_algse Durvillaea_potatorum 180 453 57 0 / 0 3298 2993
a O3 511 AA CC. CA 217 VFMAOCOARO basti Andre Frans in £A1E MMC A211 A410 A760 DATE D£7 217
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NCBI
N Biotechnology Information
National Center for
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